RNA ribossômico 18S - 18S ribosomal RNA

O RNA ribossômico 18S (abreviado 18S rRNA ) é uma parte do RNA ribossômico . O S em 18S representa as unidades Svedberg . 18S rRNA é um SSU rRNA , um componente da pequena subunidade ribossômica eucariótica ( 40S ). 18S rRNA é o RNA estrutural para o pequeno componente dos ribossomos citoplasmáticos eucarióticos e, portanto, um dos componentes básicos de todas as células eucarióticas.

18S rRNA é o homólogo citosólico eucariótico do RNA ribossômico 16S em procariotos e mitocôndrias .

Os genes que codificam para o rRNA 18S são referidos como genes do rRNA 18S . Os dados de sequência desses genes são amplamente usados ​​em análises moleculares para reconstruir a história evolutiva de organismos, especialmente em vertebrados, já que sua lenta taxa de evolução torna-os adequados para reconstruir antigas divergências.

Usos na filogenia

O gene da subunidade pequena (SSU) 18S rRNA é um dos genes mais frequentemente usados ​​em estudos filogenéticos e um importante marcador para reação em cadeia da polimerase alvo aleatória (PCR) em triagem de biodiversidade ambiental. Em geral, as sequências do gene rRNA são fáceis de acessar devido às regiões flanqueadoras altamente conservadas, permitindo o uso de primers universais . Seu arranjo repetitivo dentro do genoma fornece quantidades excessivas de DNA modelo para PCR, mesmo nos menores organismos. O gene 18S faz parte do núcleo funcional ribossomal e está exposto a forças seletivas semelhantes em todos os seres vivos. Assim, quando os primeiros estudos filogenéticos em larga escala baseados em sequências 18S foram publicados ( por exemplo, por Field et al. , 1988), o gene foi celebrado como o principal candidato para reconstruir a árvore da vida de metazoários . As sequências 18S posteriormente forneceram evidências para a divisão dos clados Ecdysozoa e Lophotrochozoa (grupo monofilético de organismos compostos de um ancestral comum e todos os seus descendentes lineares), contribuindo assim para a mudança revolucionária mais recente em nossa compreensão das relações metazoárias.

Durante a última parte dos anos 2000, e com o aumento do número de táxons incluídos nas filogenias moleculares, no entanto, dois problemas tornaram-se aparentes. Em primeiro lugar, existem impedimentos de sequenciamento prevalecentes em representantes de certos táxons, como as classes de moluscos Solenogastres e Tryblidia , táxons bivalves selecionados e a enigmática classe de crustáceos Remipedia . A falha em obter sequências 18S de taxa única é considerada um fenômeno comum, mas raramente é relatada. Em segundo lugar, em contraste com as esperanças inicialmente elevadas, 18S não pode resolver nós em todos os níveis taxonômicos e sua eficácia varia consideravelmente entre os clados. Isso foi discutido como um efeito da rápida radiação antiga em curtos períodos. As análises multigênicas são atualmente consideradas para fornecer resultados mais confiáveis ​​para rastrear eventos de ramificação profunda em Metazoa, mas 18S ainda é amplamente utilizado em análises filogenéticas.

Referências

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