Análise de variância molecular - Analysis of molecular variance

Análise de variância molecular ( AMOVA ), é um modelo estatístico para o algoritmo molecular em uma única espécie , tipicamente biológica . O nome e o modelo são inspirados na ANOVA . O método foi desenvolvido por Laurent Excoffier , Peter Smouse e Joseph Quattro na Rutgers University em 1992.

Desde o desenvolvimento do AMOVA, Excoffier escreveu um programa para executar essas análises. Este programa, que roda em Windows , se chama Arlequin e está disponível gratuitamente no site da Excoffier. Existem também implementações em linguagem R nos pacotes ade4 e pegas, ambos disponíveis no CRAN (Comprehensive R Archive Network). Outra implementação é no Info-Gen , que também roda no Windows . A versão de estudante é gratuita e totalmente funcional. O idioma nativo do aplicativo é o espanhol, mas também está disponível uma versão em inglês.

Um pacote estatístico adicional gratuito, GenAlEx, é voltado tanto para ensino quanto para pesquisa e permite que análises genéticas complexas sejam empregadas e comparadas dentro da interface comumente usada do Microsoft Excel. Este software permite o cálculo de análises como AMOVA, bem como comparações com outros tipos de estatísticas intimamente relacionadas, incluindo estatísticas F e índice de Shannon e muito mais.

Referências

  1. ^ Excoffier, L; Smouse, Pe; Quattro, Jm (junho de 1992). "Análise de variância molecular inferida a partir de distâncias métricas entre haplótipos de DNA: aplicação a dados de restrição de DNA mitocondrial humano" (Texto completo gratuito) . Genética . 131 (2): 479–91. ISSN   0016-6731 . PMC   1205020 . PMID   1644282 .
  2. ^ Peakall, R. e Smouse PE (2012) GenAlEx 6.5: análise genética em Excel. Software de genética populacional para ensino e pesquisa - uma atualização. Bioinformatics 28, 2537–2539.

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