1 JS Saint-Pierroise retirou devido aos elevados custos de viagem; eles foram proibidos de competições AFC por três anos e multado em US $ 3500. 2 Sporting Clube da Praia se recusou a viajar devido à agitação civil e uma greve geral violentos na Guiné. 3 Super ESCOM retirou. 4 AS Douanes foram expulsos da competição por escalar um jogador inelegível. 5 O empate foi jogado mais de uma perna porque AGSM não tinha um chão de padrão internacional.
Primeiro round
1º pernas foram jogados em 2-4 de Março de 2007.
2ª pernas foram jogados em 16-18 de Março de 2007.
1 O jogo foi abandonado aos 82' com Maranatha levando 2-0, depois de abril FC saiu protestando um prêmio pena contra eles; Abril FC foram expulsos da competição e proibido de competições da CAF por três anos.
Segunda rodada
1º pernas foram jogados em 6-8 abril de 2007.
2ª pernas foram jogados em 20-22 de Abril de 2007.