Cordados genômica - Chordate genomics

Genómica cordados é o estudo da evolução do cordados clado com base numa comparação dos genomas de várias espécies dentro do clado. O campo de dados depende do genoma completo (o todo da sequência de ADN ) de organismos. Ele usa comparações de sintenia blocos, translocação do cromossoma , e outros rearranjos genómicos para determinar a história evolutiva do clado, e para reconstruir o genoma das espécies de fundadores.

Resultados

filogenia

A ramificação profunda de cordados filogenia foi esclarecido pela genómica cordados. Genômica cordados demonstra que os Lancelets são o clade vivo mais basal dentro dos cordados, enquanto os Tunicados são o clade irmã para o Craniata .

sintenia

Uma comparação dos genomas do Lancelote Branchiostoma floridae , um peixe , o frango Gallus gallus , e os seres humanos Homo sapiens revelou extensa macro- sintenia com pouca ou nenhuma micro-sintenia. Isto é, em todo o clade cordados os mesmos genes são encontrados agrupados perto um do outro, embora a ordem dos genes dentro dos aglomerados foi baralhado. Existem 135 segmentos identificáveis no genoma humano que retêm sintenia com o cordados ancestral cariótipo .

análise Sintenia indica que havia 17 cromossomos no último ancestral comum ao cordados.

genoma Duplicação

Várias linhas de evidência experimental sugere fortemente que duas vezes na linhagem que conduz à teleósteos peixe do genoma cordados ancestral foi duplicado. Uma comparação entre os genomas do Lancelote Branchiostoma floridae , o Tunicados intestinalis Ciona e Oikopleura dioica , a lampreia Petromyzon marinus , os peixes Fugu rubripes e Gasterosteus aculeatus , a galinha Gallus gallus , e humanos Homo sapiens confirmou que duas duplicações todo o genoma ocorreu em o início da história do Vertebrados clade.

Referências

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