Fator de alongamento - Elongation factor

"EF2" e "EF-2" redirecionam aqui. Para a classificação de intensidade de tornado, consulte Escala Fujita aprimorada § Parâmetros .
Complexo ternário de EF-Tu (azul), tRNA (vermelho) e GTP (amarelo). Retirado dos Fatores de alongamento da molécula do mês do PDB , setembro de 2006.

Fatores de alongamento são um conjunto de proteínas que funcionam no ribossomo , durante a síntese de proteínas , para facilitar o alongamento translacional da formação da primeira à última ligação peptídica de um polipeptídeo em crescimento . Os fatores de alongamento mais comuns em procariotos são EF-Tu , EF-Ts , EF-G . Bactérias e eucariotos usam fatores de alongamento que são amplamente homólogos entre si, mas com estruturas distintas e diferentes nomenclaturas de pesquisa.

O alongamento é a etapa mais rápida da tradução. Nas bactérias , ocorre a uma taxa de 15 a 20 aminoácidos adicionados por segundo (cerca de 45-60 nucleotídeos por segundo). Em eucariotos, a taxa é de cerca de dois aminoácidos por segundo (cerca de 6 nucleotídeos lidos por segundo). Os fatores de alongamento desempenham um papel na orquestração dos eventos desse processo e na garantia da tradução de alta precisão nessas velocidades.

Nomenclatura de EFs homólogos

Fatores de alongamento
Bacteriana Eukaryotic / Archaeal Função
EF-Tu eEF-1A (α) medeia a entrada do aminoacil tRNA em um local livre do ribossomo .
EF-Ts eEF-1B ( β γ ) serve como o fator de troca de nucleotídeo guanina para EF-Tu, catalisando a liberação de PIB de EF-Tu.
EF-G eEF-2 catalisa a translocação do tRNA e mRNA para baixo do ribossomo no final de cada rodada de alongamento do polipeptídeo. Causa grandes mudanças de conformação.
EF-P eIF-5A possivelmente estimula a formação de ligações peptídicas e resolve paralisações.
EF-4 (Nenhum) Revisão
Observe que EIF5A, o homólogo arqueano e eucariótico de EF-P, foi nomeado como um fator de iniciação, mas agora considerado um fator de alongamento também.

Além de sua maquinaria citoplasmática, as mitocôndrias e plastídios eucarióticos têm sua própria maquinaria de tradução, cada uma com seu próprio conjunto de fatores de alongamento do tipo bacteriano. Em humanos, eles incluem TUFM , TSFM , GFM1 , GFM2 , GUF1 ; o fator de liberação nominal MTRFR também pode desempenhar um papel no alongamento.

Em bactérias, o selenocisteinil-tRNA requer um fator de alongamento especial SelB ( P14081 ) relacionado ao EF-Tu. Alguns homólogos também são encontrados em archaea, mas as funções são desconhecidas.

Como um alvo

Fatores de alongamento são alvos para as toxinas de alguns patógenos. Por exemplo, Corynebacterium diphtheriae produz a toxina da difteria , que altera a função da proteína no hospedeiro ao inativar o fator de alongamento (EF-2). Isso resulta na patologia e nos sintomas associados à difteria . Da mesma forma, a exotoxina A de Pseudomonas aeruginosa inativa EF-2.

Referências

Leitura adicional

  • Alberts, B. et al. (2002). Molecular Biology of the Cell , 4ª ed. Nova York: Garland Science. ISBN  0-8153-3218-1 .
  • Berg, JM et al. (2002). Biochemistry , 5ª ed. Nova York: WH Freeman and Company. ISBN  0-7167-3051-0 .
  • Singh, BD (2002). Fundamentals of Genetics , New Delhi, India: Kalyani Publishers. ISBN  81-7663-109-4 .

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