HDAC1 - HDAC1

HDAC1
Estruturas disponíveis
PDB	Pesquisa Ortholog: PDBe RCSB
Lista de códigos de id do PDB
	4BKX , 5ICN
Identificadores
Apelido	HDAC1 , GON-10, HD1, RPD3, RPD3L1, histona desacetilase 1, KDAC1
IDs externos	OMIM : 601241 MGI : 108086 HomoloGene : 68426 GeneCards : HDAC1
Localização do gene ( humano )
Chr.	Cromossomo 1 (humano)
Fim	32.333.635 bp
Localização do gene ( mouse )
Chr.	Cromossomo 4 (mouse)
Fim	129.542.713 bp
Padrão de expressão de RNA
	Mais dados de expressão de referência
Ontologia do gene
Função molecular	• GO: 0000980 RNA polimerase II cis-reguladora da região de ligação ao DNA específica da sequência ; • Atividade de histona desacetilase dependente de NAD (específica de H3-K14) ; • GO: 0001106 atividade co-pressora de transcrição ; • atividade de histona desacetilase ; • ligação de proteína N-terminal ; • GO: 0001131 , GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 atividade do fator de transcrição de ligação ao DNA ; • atividade da desacetilase da proteína ; • ligação da histona desacetilase ; • GO: 0000975 ligação da região cis-reguladora da transcrição ; • Ligação do NF-kappaB ; • atividade da desacetilase ; • GO: 0001948 ligação da proteína ; • ligação ao ADN nucleossomal ; • ligação enzima ; • actividade hidrolase ; • ligação ao ADN específica da sequência promotora nuclear ; • ligação da p53 ; • ligação do factor de transcrição ; • ligar a RNA polimerase II a ADN específica da sequência promotora nuclear ; • ligação ao ADN ; • cromatina ligação ; • Krueppel-associado caixa domínio de ligação ; • Ligação à E-box ; • ligação à cromatina específica do promotor;
Componente celular	• citoplasma ; • NURD complexo ; • citosol ; • histona desacetilase complexo ; • complexo Sin3 ; • nucleoplasma ; • núcleo ; • cromatina ; • heterocromatina ; • transcrição regulador complexo ; • repressor de transcrição complexa ; • complexo contendo proteína ; • corpo celular neuronal ; • complexo Sin3-tipo;
Processo biológico	• formação de folículo piloso placódico ; • diferenciação de células epidérmicas ; • remodelação da cromatina ; • regulação da transcrição, modelada por DNA ; • processo rítmico ; • regulação negativa da via de sinalização do receptor de andrógeno ; • morfogênese embrionária de dígitos ; • regulação negativa do processo apoptótico ; • coagulação sanguínea ; • regulação negativa da transcrição por RNA polimerase II ; • desenvolvimento da pálpebra em olho tipo câmera ; • regulação circadiana da expressão gênica ; • regulação negativa da expressão gênica ; • remodelação da cromatina dependente de ATP ; • regulação positiva da transcrição, modelada por DNA ; • odontogênese de dente contendo dentina ; • desacetilação de proteínas ; • histona Desacetilação H4 ; • formação de papila fungiforme ; • regulação negativa da diferenciação do miotubo ; • GO: 0022415 processo viral ; • desacetilação de histonas ; • regulação negativa da via de sinalização Wnt canônica ; • regulação positiva da transcrição pela RNA polimerase II ; • transcrição, modelada por DNA ; • regulação da transdução de sinal por p53 c mediador de segunda • montagem de heterocromatina dependente da metilação do DNA ; • montagem do complexo beta-catenina-TCF • modificação da cromatina covalente • organização da cromatina • regulação positiva da proliferação da população de células • regulação negativa da transcrição, modelada por DNA • desacetilação de histona H3 • regulação da diferenciação de megacariócitos • regulação da transcrição pela RNA polimerase II • desenvolvimento de endoderme • ritmo circadiano • desenvolvimento de hipocampo • diferenciação de neurônios • regulação negativa da sinalização de I-kappaB quinase / NF-kappaB • regulação positiva da diferenciação de oligodendrócitos • regulação da atividade de endopeptidase • regulação da depuração de beta-amiloide • regulação negativa da via de sinalização apoptótica intrínseca; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ;
	Fontes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	3065
	433759
	ENSG00000116478
	ENSMUSG00000028800
	Q13547
	O09106
	NM_004964
	NM_008228
	NP_004955
	NP_032254
	Wikidata
Ver / Editar Humano	Ver / Editar Mouse

A histona desacetilase 1 ( HDAC1 ) é uma enzima que em humanos é codificada pelo gene HDAC1 .

Função

A acetilação e desacetilação de histonas , catalisadas por complexos de multissubunidades, desempenham um papel fundamental na regulação da expressão de genes eucarióticos . A proteína codificada por este gene pertence à família histona desacetilase / acuc / apha e é um componente do complexo histona desacetilase. Também interage com a proteína supressora de tumor do retinoblastoma e este complexo é um elemento chave no controle da proliferação e diferenciação celular. Junto com a proteína-2 MTA2 associada à metástase , ele desacetila o p53 e modula seu efeito no crescimento celular e na apoptose.

Organismos modelo

*Fenótipo de* camundongo nocaute *Hdac1*
Característica	Fenótipo
Viabilidade homozigota	Anormal
Estudo letal recessivo	Anormal
Fertilidade	Normal
Peso corporal	Normal
Ansiedade	Normal
Avaliação neurológica	Normal
Força de preensão	Normal
Prato quente	Normal
Dismorfologia	Normal
Calorimetria indireta	Normal
Teste de tolerância à glicose	Normal
Resposta auditiva do tronco cerebral	Normal
DEXA	Normal
Radiografia	Normal
Temperatura corporal	Normal
Morfologia do olho	Normal
Química Clínica	Normal
Hematologia	Normal
Linfócitos de sangue periférico	Normal
Teste de micronúcleo	Normal
Peso do coração	Normal
Histopatologia do cérebro	Normal
Histopatologia do olho	Normal
Infecção por Salmonella	Normal
Infecção por Citrobacter	Normal
Todos os testes e análises de

Organismos modelo têm sido usados no estudo da função HDAC1. Uma linha de ratos knockout condicional , chamada Hdac1 ^{tm1a (EUCOMM) Wtsi} foi gerada como parte do programa International Knockout Mouse Consortium - um projeto de mutagênese de alto rendimento para gerar e distribuir modelos animais de doenças para cientistas interessados - no Wellcome Trust Sanger Institute . Os animais machos e fêmeas foram submetidos a uma triagem fenotípica padronizada para determinar os efeitos da deleção. Vinte e cinco testes foram realizados e dois fenótipos foram relatados. Um número reduzido de embriões mutantes homozigotos foi identificado durante a gestação e nenhum sobreviveu até o desmame . Os demais testes foram realizados em camundongos adultos mutantes heterozigotos , e nenhuma anormalidade significativa foi observada nesses animais.

Interações

HDAC1 demonstrou interagir com:

Receptor de andrógeno ,
BCL6 ,
BTG2 ,
BUB1B ,
BUB1 ,
BUB3 ,
CBFA2T3 ,
CDC20 ,
CDH1 ,
CHD3 ,
CHD4 ,
COUP-TFII ,
CTBP1 ,
DDX17 ,
DDX5 ,
DNMT3A ,
DNMT3L ,
Proteína 6 associada à morte ,
EED ,
EVI1 ,
EZH2 ,
FKBP3 ,
GATA1 ,
HMG20B ,
HSPA4 ,
HUS1 ,
Histona desacetilase 2 ,
Proteína Homeobox TGIF1 ,
Fator de célula hospedeira C1 ,
IFRD1 ,
IKZF1 ,
ING1 ,
MBD3 ,
MIER1 ,
MLL ,
MTA1 ,
MTA2 ,
Mad1 ,
Mdm2 ,
Proteína 2 de domínio de ligação de metil-CpG ,
Mães contra homólogo decapentaplégico 2 ,
MyoD ,
NFKB1 ,
Co-repressor de receptor nuclear 2 ,
P21 ,
PCNA ,
PHF21A ,
Proibitina ,
Proteína de leucemia promielocítica ,
RAD9A ,
RBBP4 ,
RBBP7 ,
RCOR1 ,
RELA ,
RFC1 ,
Proteína de retinoblastoma ,
Proteína 1 semelhante ao retinoblastoma ,
Proteína 2 semelhante ao retinoblastoma ,
SAP30 ,
SATB1 ,
SIN3A ,
SIN3B ,
SPEN ,
SUDS3 ,
SUV39H1 ,
Fator de transcrição Sp1 ,
TOP2A ,
TOP2B e
Dedo de zinco e proteína contendo domínio BTB 16 .

Veja também

Referências

Leitura adicional

Wolffe AP (abril de 1996). "Histone deacetylase: a regulator of transcription" . Ciência . 272 (5260): 371–2. Bibcode : 1996Sci ... 272..371W . doi : 10.1126 / science.272.5260.371 . PMID 8602525 . S2CID 27257723 .
Ahringer J (agosto de 2000). "Complexos de histona desacetilase NuRD e SIN3 em desenvolvimento". Tendências em genética . 16 (8): 351–6. doi : 10.1016 / S0168-9525 (00) 02066-7 . PMID 10904264 .
Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (maio de 2003). "Histona desacetilases Classe II: reguladores versáteis". Tendências em genética . 19 (5): 286–93. doi : 10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8 . PMID 12711221 .
Zhang Y, Dufau ML (junho de 2003). "Mecanismos duplos de regulação da transcrição do gene do receptor do hormônio luteinizante por receptores nucleares órfãos e complexos de histona desacetilase" . The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology . 85 (2–5): 401–14. doi : 10.1016 / S0960-0760 (03) 00230-9 . PMID 12943729 . S2CID 28512341 .
Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (setembro de 2006). A regulação da transcrição do HIV-1: alvos moleculares para intervenção quimioterápica " . Revisões de pesquisas medicinais . 26 (5): 595–625. doi : 10.1002 / med.20081 . PMC 7168390 . PMID 16838299 .
Hijmans EM, Voorhoeve PM, Beijersbergen RL, van 't Veer LJ, Bernards R (junho de 1995). "E2F-5, um novo membro da família E2F que interage com p130 in vivo" . Molecular and Cellular Biology . 15 (6): 3082–9. doi : 10.1128 / mcb.15.6.3082 . PMC 230539 . PMID 7760804 .
Maruyama K, Sugano S (janeiro de 1994). "Oligo-capping: um método simples para substituir a estrutura cap de mRNAs eucarióticos com oligoribonucleotídeos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Margolis DM, Somasundaran M, Green MR (fevereiro de 1994). "O fator de transcrição humana YY1 reprime a transcrição do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 e a produção de vírions" . Journal of Virology . 68 (2): 905–10. doi : 10.1128 / JVI.68.2.905-910.1994 . PMC 236527 . PMID 8289393 .
Furukawa Y, Kawakami T, Sudo K, Inazawa J, Matsumine A, Akiyama T, Nakamura Y (1996). "Isolamento e mapeamento de um gene humano (RPD3L1) que é homólogo ao RPD3, um fator de transcrição em Saccharomyces cerevisiae". Citogenética e genética celular . 73 (1–2): 130–3. doi : 10.1159 / 000134323 . PMID 8646880 .
Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE (maio de 1997). "A atividade da histona desacetilase é necessária para a repressão transcricional completa por mSin3A" . Cell . 89 (3): 341–7. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80214-7 . PMID 9150133 . S2CID 14233219 .
Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E, Eisenman RN (maio de 1997). "Histona desacetilases associadas ao corepressor mSin3 medeiam a repressão transcricional louca" . Cell . 89 (3): 349–56. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9 . PMID 9150134 . S2CID 13490886 .
Zhang Y, Iratni R, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (maio de 1997). "Histona desacetilases e SAP18, um novo polipeptídeo, são componentes de um complexo Sin3 humano" . Cell . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80216-0 . PMID 9150135 .
Romerio F, Gabriel MN, Margolis DM (dezembro de 1997). "Repressão do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 através da nova cooperação dos fatores humanos YY1 e LSF" . Journal of Virology . 71 (12): 9375–82. doi : 10.1128 / JVI.71.12.9375-9382.1997 . PMC 230241 . PMID 9371597 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (outubro de 1997). "Construção e caracterização de uma biblioteca de cDNA enriquecida em comprimento total e enriquecida na extremidade 5 '". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Brehm A, Miska EA, McCance DJ, Reid JL, Bannister AJ, Kouzarides T (fevereiro de 1998). "Retinoblastoma proteína recrutas histona desacetilase para reprimir a transcrição". Nature . 391 (6667): 597–601. Bibcode : 1998Natur.391..597B . doi : 10.1038 / 35404 . PMID 9468139 . S2CID 4326464 .
Magnaghi-Jaulin L, Groisman R, Naguibneva I, Robin P, Lorain S, Le Villain JP, Troalen F, Trouche D, Harel-Bellan A (fevereiro de 1998). "A proteína retinoblastoma reprime a transcrição pelo recrutamento de uma histona desacetilase". Nature . 391 (6667): 601–5. Bibcode : 1998Natur.391..601M . doi : 10.1038 / 35410 . PMID 9468140 . S2CID 4315457 .
Lin RJ, Nagy L, Inoue S, Shao W, Miller WH, Evans RM (fevereiro de 1998). "Papel do complexo histona desacetilase na leucemia promielocítica aguda". Nature . 391 (6669): 811–4. Bibcode : 1998Natur.391..811L . doi : 10.1038 / 35895 . PMID 9486654 . S2CID 4383951 .
Luo RX, Postigo AA, Dean DC (fevereiro de 1998). "Rb interage com histona desacetilase para reprimir a transcrição" . Cell . 92 (4): 463–73. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80940-X . PMID 9491888 . S2CID 18857544 .

links externos

HDAC1 + proteína, + humano na Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos ( Medical Subject Headings) (MeSH)

Languages

In other projects