Interferon Lambda 3 - Interferon Lambda 3
O interferon lambda 3 (símbolo do gene: IFNL3) codifica a proteína IFNL3. O IFNL3 era anteriormente denominado IL28B , mas o Comitê de Nomenclatura do Genoma da Organização do Genoma Humano renomeou esse gene em 2013, ao atribuir um nome ao então recém-descoberto gene IFNL4 . Junto com IFNL1 (anteriormente IL29 ) e IFNL2 (anteriormente IL28A ), esses genes estão em um cluster na região cromossômica 19q13. IFNL3 compartilha ~ 96% de identidade de aminoácidos com IFNL2, ~ 80% de identidade com IFNL1 e ~ 30% de identidade com IFNL4.
Os genes do interferon lambda codificam citocinas classificadas como interferons do tipo III , que estão distantemente relacionados aos interferons do tipo I e à família IL-10 . Os interferons do tipo III são induzidos por infecção viral e interagem com um receptor de citocina heterodimérico de classe II que consiste em receptor de interleucina 10, beta (IL10RB) e receptor de interferon lambda 1 (IFNLR1) para sinalizar através da via antiviral JAK-STAT. [fornecido por RefSeq , julho de 2008].
Hepatite C
Em 2009 (ou seja, antes da descoberta do IFNL4 ), os resultados dos estudos de associação do genoma (GWAS) indicaram que polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) próximos ao IFNL3 (rs12979860, rs8099917 e outros) estavam fortemente associados à resposta ao interferon-α peguilado e tratamento com ribavirina para hepatite C crônica, bem como eliminação espontânea da infecção por hepatite C (HCV). O gene então conhecido como IL28B (agora IFNL3) era o gene mais próximo conhecido na época, então essas variantes genéticas foram chamadas de “ variantes de IL28B ”. Foi assumido que as associações observadas refletiam diferenças na estrutura ou regulação desse gene. No entanto, a descoberta de IFNL4 revelou que o SNP rs12979860 está localizado no íntron 1 de IFNL4 , enquanto rs8099917 está em uma região intergênica , mas mais próximo de IFNL4. Os SNPs rs12979860 e rs8099917 estão em alto desequilíbrio de ligação com uma variante de IFNL4 ( IFNL4- ΔG / TT; rs368234815) que controla a geração da proteína IFNL4. IFNL4- ΔG / TT parece ser o polimorfismo funcional responsável pelas associações GWAS de SNPs próximos com eliminação de HCV, e IFNL4- ΔG / TT demonstrou ter associação estatística mais forte com eliminação de HCV do que rs12979860, especialmente em populações de ascendência africana em que o desequilíbrio de ligação entre essas variantes é mais fraco do que em outras populações.
Uma possível variante funcional no IFNL3 é o SNP rs4803217, que se encontra na região regulatória 3 'não traduzida . A substituição da guanina pela timina ancestral neste local aumenta a expressão do mRNA de IFNL3 ao diminuir a degradação do mRNA e a ligação do microRNA induzida pelo HCV e altera a estrutura do RNA. Existe um alto desequilíbrio de ligação entre rs4803217 e a variante IFNL4- ΔG / TT. Foi demonstrado que rs4803217 se associa com a eliminação do HCV, no entanto, essa associação parece resultar do desequilíbrio de ligação com IFNL4- ΔG / TT em vez de um efeito funcional direto do próprio SNP rs4803217.
Referências
Leitura adicional
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