Iodoacetamida - Iodoacetamide

Iodoacetamida
Fórmula Esquelética
Modelo de preenchimento de espaço
Nomes
Nome IUPAC preferido
2-Iodoacetamida
Identificadores
Modelo 3D ( JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
ECHA InfoCard 100,005,119 Edite isso no Wikidata
Número EC
Número RTECS
UNII
Propriedades
C 2 H 4 I N O
Massa molar 184,964  g · mol −1
Aparência cristais brancos (coloração amarela indica a presença de iodo)
Ponto de fusão 94 ° C (201 ° F; 367 K)
Perigos
Ficha de dados de segurança MSDS 1 , MSDS 2
NFPA 704 (diamante de fogo)
Exceto onde indicado de outra forma, os dados são fornecidos para materiais em seu estado padrão (a 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
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Referências da Infobox

2-Iodoacetamida é um agente alquilante usado para fins de mapeamento de peptídeos . Suas ações são semelhantes às do iodoacetato . É comumente usado para se ligar covalentemente ao grupo tiol da cisteína, de modo que a proteína não pode formar ligações dissulfeto . Também usado em estudos de ubiquitina como um inibidor das enzimas deubiquitinase (DUBs) porque alquila os resíduos de cisteína no sítio ativo de DUB.

Inibidor de peptidase

A iodoacetamida é um inibidor irreversível de todas as cisteína peptidases, com o mecanismo de inibição ocorrendo a partir da alquilação do resíduo de cisteína catalítica (ver esquema). Em comparação com seu derivado ácido, o iodoacetato, a iodoacetamida reage substancialmente mais rápido. Esta observação parece contraditória com a reatividade química padrão, no entanto, a presença de uma interação favorável entre o íon imidazólio positivo da histidina catalítica e o grupo carboxila carregado negativamente do iodoacetato é a razão para o aumento da atividade relativa da iodoacetamida.

Mecanismo de inibição irreversível de cisteína peptidases com iodoacetamida.

Espectrometria de massa de proteína

É comumente usado durante a preparação da amostra para sequenciamento de novo (peptídeo) com espectrometria de massa de proteína , mas críticos recentes sugerem evitar o uso dele

Referências

links externos

  • O banco de dados online MEROPS para peptidases e seus inibidores: [1]