JAligner - JAligner

JAligner é uma fonte aberta Java implementação do algoritmo de Smith-Waterman com a melhoria da Gotoh para pares locais biológica alinhamento de sequência utilizando o penalidade de lacuna afim modelo. Foi escrito por Ahmed Moustafa.

Veja também

Referências

  1. ^ Smith TF e Waterman MS (1981). Identificação de subsequências moleculares comuns. J Mol Biol, 147: 195-197 .
  2. ^ Gotoh O (1982). Um algoritmo melhorado para correspondentes sequências biológicas. J Mol Biol, 162: 705-708 .

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