precursor de microRNA mir-29 - mir-29 microRNA precursor
| precursor de microRNA mir-29 | |
|---|---|
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| Identificadores | |
| Símbolo | mir-29 |
| Rfam | RF00074 |
| miRBase | MI0000087 |
| família miRBase | MIPF0000009 |
| Outros dados | |
| Tipo de RNA | Gene ; miRNA |
| Domínio (s) | Eukaryota |
| IR | GO: 0035195 GO: 0035068 |
| TÃO | SO: 0001244 |
| Estruturas PDB | PDBe |
O precursor do microRNA miR-29 , ou pré-miRNA, é uma pequena molécula de RNA na forma de uma haste ou grampo de cabelo . Cada braço do grampo de cabelo pode ser processado em um membro de uma família intimamente relacionada de RNAs curtos não codificantes que estão envolvidos na regulação da expressão gênica . Os produtos processados ou "maduros" da molécula precursora são conhecidos como microRNA (miRNA) e foram previstos ou confirmados em uma ampla gama de espécies ( ver 'MIPF0000009' em miRBase: o banco de dados de microRNA ).
processamento de miRNA
Os miRNAs de animais são primeiro transcritos como uma molécula de miRNA primária. Este "pri-miRNA" pode conter um ou mais grampos de cabelo precursores, que são liberados do pri-miRNA pela enzima nuclear Drosha . O hairpin precursor de aproximadamente 70 nucleotídeos é exportado do núcleo e subsequentemente processado pela enzima Dicer para dar um miRNA maduro que tem em média 22 nucleotídeos de comprimento. Qualquer braço do precursor pode render um RNA maduro, embora o braço 3 '(3p) ou 5' (5p) seja preferencialmente processado e carregado no complexo de silenciamento induzido por RNA (RISC) na maioria dos casos. Para o precursor miR-29, o braço 3 'do RNA precursor produz o produto predominantemente predominante (miR-29 ou miR-29-3p), embora o braço 5' (miR-29 * ou miR-29-5p) tenha também foi verificado experimentalmente.
A família miR-29
Muitos genomas de mamíferos codificam quatro precursores miR-29 intimamente relacionados que são transcritos em duas unidades de transcrição. Por exemplo, miR-29a e miR-29b-1 humanos são processados a partir de um íntron de um longo transcrito não codificante (LOC646329) do cromossomo 7. miR-29b-2 (idêntico em sequência a miR-29b-1) e miR -29c são co-transcritos do cromossomo 1. Os três principais miRNAs maduros processados a partir desses precursores são conhecidos como has-miR-29a, has-miR-29b e has-miR-29c.
A análise de sobrevivência em três conjuntos de dados independentes mostra que o hsa-miR-29c está associado à sobrevivência no câncer de mama.
Alvos de miR-29
Acredita-se que os produtos maduros exerçam funções regulatórias ligando-se com complementaridade parcial aos elementos de reconhecimento de microRNA (MREs) na região 3 'não traduzida (3' UTR) dos transcritos alvo. A evidência experimental sugere que os alvos putativos de produtos miR-29 maduros incluem o seguinte:
- A proteína de leucemia mielóide diferenciação celular (MCL1), um anti- apoptótica membro da Bcl-2 família de proteínas.
- O TCL1A (células T de leucemia / linfoma de 1) oncogene , verificou-se ser interrompido em diversos de células T leucemias , mas também desregulado malignidades de células B.
- DNA metiltransferases DNMT3A e DNMT3B , que são freqüentemente reguladas positivamente no câncer de pulmão .
- Homólogo de proteína de dedo de zinco 36 (ZFP36), também conhecido como tristetraprolina (TTP), um gene antiinflamatório e anticâncer.
- O fator 4 associado ao receptor do fator de necrose tumoral (TRAF4) foi identificado como alvo miR-29 em células B e como um regulador da sinalização de CD40
Recentemente, em uma tentativa de identificar alvos em nível global usando a abordagem de proteômica quantitativa - SILAC , VDAC1 e VDAC2 foram identificados como alvos de miR-29a em células HEK293T .
Referências
Leitura adicional
- Zhang X, Zhao X, Fiskus W, Lin J, Lwin T, Rao R, Zhang Y, Chan JC, Fu K, Marquez VE, Chen-Kiang S, Moscinski LC, Seto E, Dalton WS, Wright KL, Sotomayor E, Bhalla K, Tao J (outubro de 2012). "Silenciamento coordenado de miR-29 mediado por MYC por HDAC3 e EZH2 como um alvo terapêutico da modificação de histonas em linfomas de células B agressivos" . Cancer Cell . 22 (4): 506–23. doi : 10.1016 / j.ccr.2012.09.003 . PMC 3973134 . PMID 23079660 .
links externos