Fenoma - Phenome

Um fenômeno é o conjunto de todos os fenótipos expressos por uma célula , tecido , órgão , organismo ou espécie .

Assim como o genoma e o proteoma significam todos os genes e proteínas de um organismo, o fenômeno representa a soma de seus traços fenotípicos. Exemplos de traços fenotípicos humanos são cor da pele , cor dos olhos , altura do corpo ou características específicas de personalidade . Embora qualquer fenótipo de qualquer organismo tenha uma base em seu genótipo, a expressão fenotípica pode ser influenciada por influências ambientais, mutação e variação genética, como polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) ou uma combinação desses fatores.

Fenômica é o estudo do fenômeno e como ele é determinado, principalmente quando estudado em relação ao conjunto de todos os genes ( genômica ) ou de todas as proteínas ( proteômica ).

Origem e uso

O termo foi usado pela primeira vez por Davis em 1949, "Nós aqui propomos o nome de fenômeno para a soma total das porções extragênicas e não autoreprodutivas da célula, sejam citoplasmáticas ou nucleares. O fenômeno seria a base material do fenótipo, assim como o genoma é a base material do genótipo. "

Embora o fenômeno esteja em uso por muitos anos, a distinção entre o uso do fenômeno e do fenótipo é problemática. Uma definição proposta para ambos os termos como a "totalidade física de todas as características de um organismo ou de um de seus subsistemas" foi apresentada por Mahner e Kary em 1997, que argumentam que embora os cientistas tendam a usar intuitivamente esses e outros termos relacionados de uma maneira isso não impede a pesquisa, os termos não são bem definidos e o uso dos termos não é consistente.

Alguns usos do termo sugerem que o fenômeno de um determinado organismo é mais bem compreendido como uma espécie de matriz de dados que representa a manifestação física do fenótipo. Por exemplo, as discussões conduzidas por A.Varki entre aqueles que usaram o termo até 2003 sugeriram a seguinte definição: “O corpo de informações que descreve os fenótipos de um organismo, sob a influência de fatores genéticos e ambientais”. Outra equipe de pesquisadores caracteriza "o fenômeno humano [como] um espaço de busca multidimensional com vários níveis neurobiológicos, abrangendo o proteoma, sistemas celulares (por exemplo, vias de sinalização), sistemas neurais e fenótipos cognitivos e comportamentais."

Biólogos vegetais começaram a explorar o fenômeno no estudo da fisiologia vegetal.

Em 2009, uma equipe de pesquisa demonstrou a viabilidade de identificar associações genótipo-fenótipo usando registros eletrônicos de saúde (EHRs) vinculados a biobancos de DNA . Eles chamaram este método de estudo de associação do fenômeno (PheWAS).

Veja também

Referências

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