Pithovirus -Pithovirus

Pithovirus
Pithovirus sibericum sketch.jpg
Classificação de vírus
Grupo:
Grupo I ( dsDNA )
Pedido:
Megavirales
Família:
Pithoviridae
Gênero:
Pithovirus
Espécies
  • P. massiliensis
  • P. sibericum

Pithovirus , descrito pela primeira vez em um artigo de 2014, é um gênero de vírus gigante conhecido de duas espécies, Pithovirus sibericum , que infecta amebas e Pithovirus massiliensis . É umvírus de DNA de fita dupla e é membro do clado de grandes vírus de DNA nucleocitoplasmático . A descoberta de 2014 foi feita quando um espécime viável foi encontrado em um núcleo de gelo de 30.000 anoscolhido de permafrost na Sibéria , Rússia.

Descrição

O nome do gênero Pithovirus , uma referência a grandes recipientes de armazenamento da Grécia antiga conhecido como pithoi , foi escolhido para descrever a nova espécie. Uma amostra de Pithovirus mede aproximadamente 1,5  μm (1500 nm ) de comprimento e 0,5 μm (500 nm) de diâmetro, tornando-o o maior vírus já encontrado. É 50% maior em tamanho que o Pandoraviridae , o maior vírus conhecido anteriormente, é maior que o Ostreococcus, a menor célula eucariótica, embora o Pandoravírus tenha o maior genoma viral, contendo 1,9 a 2,5 megabases de DNA .

O pitovírus possui uma parede oval espessa com uma abertura em uma das extremidades. Internamente, sua estrutura se assemelha a um favo de mel .

O genoma do Pithovirus contém 467 genes distintos , mais do que um vírus típico, mas muito menos do que as 2556 sequências de codificação de proteínas putativas encontradas no Pandoravirus . Assim, seu genoma é muito menos densamente compactado do que qualquer outro vírus conhecido. Dois terços de suas proteínas são diferentes das de outros vírus. Apesar da semelhança física com o Pandoravirus , a sequência do genoma do Pithovirus revela que ele mal é relacionado a esse vírus, mas se assemelha mais aos membros de Marseilleviridae , Megaviridae e Iridoviridae . Todas essas famílias contêm grandes vírus icosaédricos com genomas de DNA. O genoma do Pithovirus tem 36% de conteúdo em GC , semelhante ao Megaviridae , em contraste com mais de 61% para os pandoravírus.

Replicação

O genoma do pitovírus é um cromossomo circular de DNA de fita dupla ( dsDNA ) de cerca de 610.000 pares de bases (pb), codificando aproximadamente 467 quadros de leitura aberta (ORFs), que se traduzem em 467 proteínas diferentes. O genoma codifica todas as proteínas necessárias para produzir mRNA ; essas proteínas estão presentes nos virions purificados. Pithovirus, portanto, passa por todo o seu ciclo de replicação no citoplasma de seu hospedeiro , em vez do método mais típico de assumir o controle do núcleo do hospedeiro.

Descoberta

Pithovirus sibericum foi descoberto em uma amostra de 30.000 anos de permafrost siberiano por Chantal Abergel e Jean-Michel Claverie da Universidade de Aix-Marseille . O vírus foi descoberto enterrado 30 m (100 pés) abaixo da superfície de um sedimento do final do Pleistoceno . Foi encontrado quando amostras de margens de rio coletadas em 2000 foram expostas a amebas . As amebas começaram a morrer e, quando examinadas, descobriram que continham espécimes de vírus gigantes. Os autores disseram que tiveram a ideia de sondar amostras de permafrost em busca de novos vírus depois de ler sobre um experimento que reviveu uma semente envelhecida semelhante de Silene stenophylla dois anos antes. As descobertas do Pithovirus foram publicadas nos Proceedings of the National Academy of Sciences em março de 2014. Embora o vírus seja inofensivo para os humanos, sua viabilidade após ser congelado por milênios levantou preocupações de que as mudanças climáticas globais e as operações de perfuração de tundra poderiam levar a operações não descobertas e vírus potencialmente patogênicos sendo descobertos. No entanto, outros cientistas contestam que esse cenário seja uma ameaça real.

Uma espécie moderna do gênero, Pithovirus massiliensis , foi isolada em 2016. As características centrais como a ordem das ORFs e genes órfãos (ORFans) estão bem conservadas entre as duas espécies conhecidas.

Evolução

A taxa de mutação do genoma foi estimada em 2,23 × 10 -6 substituições / local / ano. Os autores sugeriram que esses vírus evoluíram pelo menos centenas de milhares de anos atrás.

Veja também

Referências

links externos