Sequência de reconhecimento - Recognition sequence

Uma sequência de reconhecimento é uma sequência de DNA para a qual um motivo estrutural de um domínio de ligação de DNA exibe especificidade de ligação. As sequências de reconhecimento são palíndromos .

O fator de transcrição Sp1, por exemplo, liga as sequências 5 '- (G / T) GGGCGG (G / A) (G / A) (C / T) -3', onde (G / T) indica que o domínio se ligará uma guanina ou timina nesta posição.

A endonuclease de restrição PstI reconhece, liga e cliva a sequência 5'-CTGCAG-3 '.

Uma sequência de reconhecimento é diferente de um site de reconhecimento . Uma determinada sequência de reconhecimento pode ocorrer uma ou mais vezes, ou não ocorrer, em um fragmento de DNA específico. Um site de reconhecimento é especificado pela posição do site. Por exemplo, existem dois locais de reconhecimento PstI no seguinte fragmento de sequência de DNA, começando na base 9 e 31, respectivamente. Uma sequência de reconhecimento é uma sequência específica, geralmente muito curta (menos de 10 bases). Dependendo do grau de especificidade da proteína, uma proteína de ligação ao DNA pode se ligar a mais de uma sequência específica. Para PstI, que tem uma especificidade de sequência única, é 5'-CTGCAG-3 '. É sempre o mesmo no primeiro local de reconhecimento ou no segundo na sequência de exemplo a seguir. Para Sp1, que tem especificidade de sequência múltipla (16) como mostrado acima, os dois locais de reconhecimento no fragmento de sequência de exemplo a seguir estão em 18 e 32, e suas respectivas sequências de reconhecimento são 5'-GGGGCGGAGC-3 'e 5'-TGGGCGGAAC- 3 '.

5'-AACGTTAG CTGCAG TC GGGGCGGAGC TAGG CTGCAG GAAT TGGGCGGAAC CT-3 '

Veja também

Referências


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