"Secret of My Heart" estreou em segundo lugar no Oricon Weekly Singles Chart com 410.550 cópias físicas vendidas. A canção ficou nas paradas por 16 semanas e vendeu mais de 968.980 cópias físicas. "Secret of My Heart" se tornou a segunda canção mais vendida da cantora atrás de " Love, Day After Tomorrow " (1999) e recebeu o certificado Million pelas vendas físicas e Ouro pelas vendas digitais pela Recording Industry Association of Japan .