Terri Attwood - Terri Attwood
Terri Attwood | |
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 Retrato de Terri Attwood por Linda Bussey
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| Nascermos |
Teresa K. Attwood
20 de novembro de 1959 |
| Alma mater | University of Leeds |
| Conhecido por | |
| Prêmios | Royal Society University Research Fellowship 1993-2002 |
| Carreira científica | |
| Campos |
Impressão digital de proteínas de bioinformática |
| Instituições | |
| Tese | Mesofases cromônicas (1984) |
| Orientador de doutorado | John E. Lydon |
| Alunos de doutorado | |
| Local na rede Internet | |
Teresa K. Attwood é um professor de Bioinformática no Departamento de Ciência da Computação e Escola de Ciências Biológicas na Universidade de Manchester e uma visita companheiro no Instituto de Bioinformática Europeia (EMBL-EBI) . Ela recebeu uma bolsa de pesquisa da Royal Society University no University College London (UCL) de 1993 a 1999 e na University of Manchester de 1999 a 2002.
Educação
Attwood obteve seu bacharelado em Biofísica pela University of Leeds em 1982. Ela recebeu um PhD , também em Biofísica, dois anos depois, em 1984 sob a supervisão de John E. Lydon estudando mesofases cromônicas .
Pesquisa e carreira
Attwood realizou pesquisa de pós-doutorado em Leeds até 1993, quando se mudou para a University College London por cinco anos antes de se mudar para a University of Manchester em 1999. Sua pesquisa diz respeito ao alinhamento da sequência de proteínas e análise de proteínas .
Inspirado pela criação do PROSITE , Attwood desenvolveu um método de impressão digital de proteínas e usou-o para estabelecer o banco de dados PRINTS . Com Amos Bairoch, ela buscou unificar o trabalho na classificação e anotação da família de proteínas , eventualmente garantindo em conjunto com Rolf Apweiler uma bolsa da União Europeia para estabelecer a InterPro , com Pfam , ProDom e Swiss-Prot / TrEMBL como parceiros do consórcio em 1997.
Attwood liderou grandes projetos, incluindo o consórcio de mineração de texto BioMinT FP5 , o consórcio de educação em bioinformática EMBER (incluindo EBI e o Instituto Suíço de Bioinformática como parceiros) e a plataforma EPSRC PARADIGM. Ela é a investigadora principal de Manchester nos projetos SeqAhead ( rede de análise de dados de sequenciamento de última geração ) e AllBio (infraestrutura de bioinformática para ciências unicelulares, animais e vegetais), e também foi PI em Manchester em EMBRACE e EuroKUP (proteômica de rins e urina). Attwood foi membro do Comitê de Estratégia de Treinamento em Bioinformática do ELIXIR (Pacote de Trabalho 11) durante a fase preparatória do ELIXIR. Atualmente é presidente da EMBnet Global Bioinformatics Network, foi membro dos Comitês Executivos da International Society for Biocuration e da Bioinformatics Training Network, e foi recentemente eleita para o Conselho de Administração da International Society for Computational Biology. Em 2012, ela liderou o estabelecimento de uma GOBLET (Organização Global para Aprendizagem, Educação e Treinamento em Bioinformática), com as principais sociedades, redes e organizações de bioinformática, biologia computacional e biocuração, redes e organizações. Desde 2016, Attwood é Presidente do Conselho Executivo do GOBLET .
Além de biocuradora, ela co-desenvolveu ferramentas para alinhar e visualizar sequências e estruturas de proteínas, incluindo Ambrosia e CINEMA. O grupo está construindo componentes de software reutilizáveis para criar aplicativos de bioinformática úteis por meio de UTOPIA (ferramentas de bioinformática) e está desenvolvendo novas abordagens para anotação automática e mineração de texto , como PRECIS, METIS, BioIE e abordagens semânticas para integração de dados, como o Semantic Biochemical Journal publicado pela Portland Press . As ferramentas UTOPIA sustentam o Semantic Biochemical Journal e um projeto colaborativo com a Pfizer e a AstraZeneca para desenvolver uma interface do século 21 para a literatura biomédica e gerenciamento de dados.
A pesquisa de Attwood recebeu financiamento do Conselho de Pesquisa em Ciências Físicas e de Engenharia , Conselho de Pesquisa em Biotecnologia e Ciências Biológicas , Wellcome Trust , Royal Society , União Europeia e indústria.
Ensino
Attwood leciona em cursos de graduação e pós- graduação e tem sido orientador de doutorado ou co-orientador de vários alunos de doutorado (por exemplo, Manuel Corpas ). Attwood é co-autor de vários capítulos de livros e três livros-texto de bioinformática populares: Introdução à Bioinformática e Bioinformática e Evolução Molecular . Attwood é co-autor do livro de bioinformática Bioinformatics Challenges at the Interface of Biology and Computer Science: Mind the Gap com Steve Pettifer e Dave Thorne.
Serviço acadêmico
Attwood faz parte do conselho editorial do Biochemical Journal , Database: The Journal of Biological Databases and Curation , Molecular and Cellular Proteomics , do Journal of Molecular Graphics e Modeling e do EMBnet.journal.
Prêmios e honras
Attwood recebeu uma bolsa de pesquisa da Royal Society University (URF) de 1993 a 2002.