Thermococcus litoralis - Thermococcus litoralis
Thermococcus litoralis | |
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Classificação científica | |
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Espécies: |
T. litoralis
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Nome binomial | |
Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001
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Thermococcus litoralis ( T. litoralis ) é uma espécie de arquéia encontrada em fontes hidrotermais profundas, bem como em fontes termais rasas submarinas e poços de petróleo. É um hipertermófilo organotrófico anaeróbio com diâmetro entre 0,5–3,0 μm (20–118 μin). Tal como as outras espécies nas Thermococcales ordem, T. litoralis é um hipertermilo irregular coccus que cresce entre 55-100 ° C (131-212 ° F). Ao contrário de muitos outros termococos, T. litoralis não tem mobilidade . Sua parede celular consiste apenas em uma única camada S que não forma redes hexagonais. Além disso, embora muitos termococcales usem obrigatoriamente o enxofre como um aceptor de elétrons no metabolismo, o T. litoralis só precisa do enxofre para ajudar a estimular o crescimento e pode viver sem ele. T. litoralis foi recentemente popularizado pela comunidade científica por sua capacidade de produzir uma polimerase de DNA alternativa à polimerase Taq comumente usada. Apolimerase de T. litoralis , apelidada de polimerase de ventilação, demonstrou ter uma taxa de erro mais baixa do que Taq, mas devido às suascapacidades de exonuclease 3'-5 'de revisão .
DNA polimerase
DNA polimerase | |||||||
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Identificadores | |||||||
Organismo | |||||||
Símbolo | pol | ||||||
UniProt | P30317 | ||||||
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A DNA polimerase de Thermococcus litoralis é estável em altas temperaturas, com meia-vida de oito horas a 95 ° C (203 ° F) e duas horas a 100 ° C (212 ° F). Ele também tem uma atividade de revisão que é capaz de reduzir as frequências de mutação a um nível 2–4 vezes menor do que a maioria das DNA polimerases não revisadas.
Habitat e ecologia
T. litoralis cresce perto de fontes hidrotermais rasas e profundas em águas extremamente quentes. A temperatura ótima de crescimento para T. litoralis é 85–88 ° C. Ele também prefere águas ligeiramente ácidas, crescendo entre pH 4,0 a 8,0 com o pH ideal entre 6,0-6,4. Ao contrário de muitos outros hipertermófilos, T. litoralis é apenas facultativamente dependente do enxofre como um aceptor final de elétrons na fermentação, produzindo gás hidrogênio em sua ausência e sulfeto de hidrogênio quando presente. Além disso, T. litoralis demonstrou produzir um exopolissacarídeo (EPS) que possivelmente poderia ajudá-lo a formar um biofilme . É feito de manose , sulfitos e fósforo.
Fisiologia
T. litoralis pode utilizar piruvato , maltose e aminoácidos como fontes de energia. Em um ambiente de laboratório, T. litoralis deve ser fornecido com aminoácidos para crescer em taxas não reduzidas. Os únicos aminoácidos de que não necessita são asparagina , glutamina , alanina e glutamato . Esses aminoácidos podem não ser vitais para T. litoralis porque a asparagina e a glutamina tendem a desaminar em altas temperaturas encontradas em torno das fontes hidrotérmicas e a alanina e o glutamato geralmente podem ser produzidos por outras arquéias hipertermofílicas. A principal fonte de carbono para T. litoralis parece ser a maltose, que pode ser trazida para a célula por meio de um transportador ABC de maltose- trealose . T. litoralis tem uma via glicolítica especializada chamada via modificada de Embden-Meyerhoff (EM). Uma maneira pela qual a via EM modificada em T. litoralis se desvia da via EM comum é que a versão modificada contém uma hexose quinase dependente de ADP e PFK em vez de versões dependentes de ATP das enzimas.
Novas linhagens
Uma nova análise de DNA mostrou vários isolados de T. litoralis , MW e Z-1614, que são provavelmente novas cepas. MW e Z-1614 foram confirmados como cepas de T. litoralis por meio de hibridização DNA-DNA , razões C – G (38-41% molar) e análises de imunotransferência. Eles diferem ligeiramente na morfologia do T. litoralis previamente isolado por todos terem flagelos. Através dos mesmos processos, foi demonstrado que o Caldococcus litoralis previamente descoberto era na verdade T. litoralis . O genoma de T. litoralis ainda não foi totalmente sequenciado.
Referências
Leitura adicional
- Gardner AF, Kumar S, Perler FB (maio de 2012). "Sequência do genoma do modelo hyperthermophilic archaeon Thermococcus litoralis NS-C" . Journal of Bacteriology . 194 (9): 2375–6. doi : 10.1128 / JB.00123-12 . PMC 3347054 . PMID 22493191 .
- Rivas-Pardo JA, Herrera-Morande A, Castro-Fernandez V, Fernandez FJ, Vega MC, Guixé V (20 de junho de 2013). "Estrutura cristalina, SAXS e mecanismo cinético da glucoquinase dependente de ADP hipertermofílica de Thermococcus litoralis revelam um mecanismo conservado para catálise" . PLOS ONE . 8 (6): e66687. Bibcode : 2013PLoSO ... 866687R . doi : 10.1371 / journal.pone.0066687 . PMC 3688580 . PMID 23818958 .