Lista de bancos de dados de neurociência - List of neuroscience databases
Vários bancos de dados neurocientíficos online estão disponíveis e fornecem informações sobre a expressão gênica , neurônios , estrutura macroscópica do cérebro e distúrbios neurológicos ou psiquiátricos . Alguns bancos de dados contêm dados descritivos e numéricos, alguns para a função cerebral, outros oferecem acesso a dados de imagem 'brutos', como seções cerebrais post-mortem ou imagens 3D de ressonância magnética e fMRI . Alguns se concentram no cérebro humano, outros no não humano.
À medida que cresce o número de bancos de dados que buscam disseminar informações sobre a estrutura, o desenvolvimento e a função do cérebro, também cresce a necessidade de comparar esses recursos eles próprios. Como resultado, agora existem bancos de dados de bancos de dados de neurociência, alguns dos quais alcançam mais de 3.000 entradas.
Bancos de dados de neurociência
| Nome | Descrição | Organismo | Nível (gene, neurônio, macroscópico) | Dados (MRI, fMRI, imagens, descritivo, numérico) | Transtorno | Registre-se para visualizar os dados? | Ref. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Allen Brain Atlas | Atlas, seções coradas de cérebros mostrando desenvolvimento e expressão gênica | Rato, Humano | Macroscópico, Gene | Imagens | Saudável | Não | ||
| Iniciativa de Neuroimagem da Doença de Alzheimer (ADNI) | Imagens estruturais de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Conjuntos de dados de ressonância magnética | Doença saudável e de Alzheimer | sim | ||
| Big Brain | Reconstrução 3D de cérebro completo a partir de seções histológicas coradas de corpo celular com resolução isotrópica de 20 mícrons | Humano | Microscópico | Imagens | Saudável | Não | ||
| Dados BIRN fMRI e MRI | fMRI, varreduras de ressonância magnética e atlas para cérebros humanos e de camundongos | Rato, Humano | Multinível: regiões do cérebro, conexões, neurônios, padrões de expressão gênica | Conjuntos de dados MRI, conjuntos de dados fMRI | Saudável, Idoso | Não | ||
| Banco de dados de neuroimagem de transtorno bipolar | Meta-análise e banco de dados de estudos de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Descritivo, numérico | Transtorno bipolar | Não | ||
| Sistema de gerenciamento de arquitetura cerebral | Recurso online para informações sobre circuitos neurais | Rato, camundongo, humano | Multinível: regiões do cérebro, conexões, neurônios, padrões de expressão gênica | Descritivo, numérico | Saudável | Não | ||
| Brain Cloud | Expressão gênica no córtex pré-frontal humano | Humano | Padrões de expressão gênica | Descritivo, numérico | Saudável | Não | ||
| Brain-CODE | Uma plataforma multimodal de transtorno cruzado para pesquisa neurocientífica integrada e dados do Ontario Brain Institute . | Humano, Animal | Conjuntos de dados multimodais (clínicos, de imagem, moleculares, etc.) | Descritiva, numérica, imagiológica, molecular, genética | Neurodesenvolvimento, Paralisia Cerebral, Epilepsia, Depressão, Neurodegeneração, Concussão | sim | ||
| Brain-Development.org | Imagens e atlas estruturais de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Conjuntos de dados de ressonância magnética | Fetos, recém-nascidos saudáveis e prematuros | sim | ||
| Braingraph.org | Braingraphs calculados a partir dos dados do Human Connectome Project | Humano | Macroscópico, até 1015 nós | gráficos direcionados e não direcionados em formato GraphML anotado anatomicamente | Saudável | Não | ||
| Braininfo | Atlas, atlas esquemático de Macaca fascicularis | Macaque | Macroscópico | Imagens esquemáticas | Saudável | sim | ||
| Plataforma de interface cérebro-máquina | Diferentes tipos de dados relacionados à interface cérebro-máquina | Humano, Macaco | Macroscópico, Neurônio | Imagens, numéricas | Saudável | Não | ||
| BrainMap.org | banco de dados de coordenadas fMRI | Humano | Macroscópico | Descritivo | Saudável | sim | ||
| BrainMaps | Atlas, seções de cérebros manchadas de alta resolução | Humano, primata e não primata (14 espécies ao todo) | Neurônio e macroscópico | Imagens | Saudável | Não | ||
| Brain / MINDS Dataportal | Atlas, varreduras de ressonância magnética in vivo e ex-vivo, gravações de ECoG | Sagui comum, humano | Macroscópico | Imagens | Saudável | Não | ||
| Banco de dados Brede | banco de dados de coordenadas fMRI e PET | Humano | Macroscópico | Descritivo | Saudável | Não | ||
| Brainmuseum.org / MSU Brain Biodiversity Bank | Atlas, seções manchadas de cérebros e imagens de ressonância magnética | Humano e 62 outras espécies | Macroscópico | Imagens | Saudável | Não | ||
| Brainomics / Localizer | varreduras de fMRI e MRI, dados comportamentais | Humano | Macroscópico | Imagens, numéricas | Saudável | Não | ||
| Atlas subcortical Caltech | Varreduras de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Ressonância magnética | Saudável | Não | ||
| Cambridge Center for Aging and Neuroscience (Cam-CAN) | Dados de MRI, fMRI, MEG para ~ 700 adultos saudáveis derivados da população com idade entre 18-88 | Humano | Macroscópico | Imagens, descritivas, numéricas | Saudável | Não | ||
| Arquivo de imagens de câncer | Imagens de ressonância magnética, tomografia computadorizada e PET de pacientes com câncer com dados clínicos de apoio (em muitos casos) | Humano | Macroscópico | Imagens, descritivas, numéricas | Câncer | Não | ||
| Banco de dados do transcriptoma de desenvolvimento cerebelar | Atlas, seções coradas de cérebros de camundongos mostrando desenvolvimento cerebelar e expressão gênica | Mouse | Macroscópico, Gene | Imagens | Saudável | Não | ||
| Pesquisa Colaborativa em Neurociência Computacional CRCNS.org | Muitos tipos de resultados de neurociência que são relevantes para a modelagem | Humano e várias outras espécies | Multiescala | Trens de pico, LFP, MUA, MRI | Saudável | sim | ||
| Banco de dados para experiências e modelos de alcance (DREAM) | Atingindo dados (comportamental, generalização, adaptação, aprendizagem, pico, fMRI, incerteza) | Humano e macaco | Macroscópico | Cinemático, pico, fMRI | Saudável | sim | ||
| O data center da fMRI | Conjuntos de dados fMRI de estudos publicados | Humano | Macroscópico | conjuntos de dados fMRI | Saudável | sim | ||
| Projeto GLIMPS (imagens de glicose em síndromes de Parkinson) | Internacional FDG-PET banco de dados doença neurodegenerativa varredura | Humano | Macroscópico | Imagens FDG-PET | Doença de Parkinson (PD), doença de Alzheimer (AD), atrofia de múltiplos sistemas (MSA), paralisia supranuclear progressiva (PSP), etc. | sim | ||
| Portal do hipocampo | Circuito, tipos neurais, eletrofisiologia | Humano adulto | Neurônio | Morfologia celular, eletrofisiologia, composição da região, conectividade | Saudável | sim | ||
| Banco de dados internacional de eletrofisiologia de epilepsia (IEEG.org) | EEG, metadados, imagens, anotações em dados | Modelos humanos e animais de epilepsia | EEG, campos locais, micro-ECoG | Eletrofisiologia | Não saudável, vários saudáveis | sim | ||
| Iniciativa Internacional de Compartilhamento de Dados de Neuroimagem (INDI) | Dados de conectividade funcional de muitos grupos diferentes | Invertebrados (47 espécies ao todo) | Macroscópico | Conectividade funcional | Saudável, não saudável | sim | ||
| Plataforma do cérebro de invertebrados | Fotos de dissecações do sistema nervoso de invertebrados | Invertebrados (47 espécies ao todo) | Macroscópico | Fotos | Saudável | Não | ||
| Fantasma humano in vivo | Dados de ressonância magnética de resolução ultra-alta de um único participante, incluindo 150 μm de angiografia ToF, 250 μm T1 MPRAGE, 330 μm QSM, 450 μm T2 TSE, 800 μm DTI, uma hora contínua de 1,8 mm rs-fMRI e dados estruturais adquiridos em mais de uma década | Humano | Mesoscópico | MRI estrutural com vários contrastes, ressonância magnética de microestrutura e ressonância magnética funcional | Saudável | Não | ||
| Atlas JuBrain | Mapas citoarquitetônicos 3D probabilísticos do cérebro humano | Humano | Mesoscópico | Estrutural | Saudável | Não | ||
| Kymata Atlas | Atlas funcional do córtex humano | Humano | Macroscópico | Funcional | Saudável | Não | ||
| Banco de dados de neuroimagem de transtorno depressivo maior | Meta-análise e banco de dados de estudos de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Descritivo, numérico | Transtorno Depressivo Maior | Não | ||
| Atlas do gene do sagui | Expressão do gene no cérebro inteiro do sagui comum | Sagui-comum | Macroscópico, Gene | Imagens | Saudável | Não | ||
| Biblioteca do cérebro do rato | Atlas, seções manchadas de cérebros de camundongos | Mouse | Macroscópico | Imagens | Saudável | Não | ||
| NeuroData | Conjuntos de dados volumétricos, atlas e pesquisa conectômica | Múltiplo | Multiescala | Imagens (3D, 4D) | Vários | Não | ||
| Neuroelectro.org | Eletrofisiologia dos neurônios | Humanos, outros | Neurônio | Propriedades eletrofisiológicas e dados | Saudável | Não | ||
| Neuromorpho.org | Modelos 3D de neurônios reais | Humano, rato , camundongo , macaco , outros | Neurônio | Imagens e dados 3D | Saudável | Não | ||
| Neuromorphometrics.com | Exames cerebrais de ressonância magnética rotulados manualmente | Humano | Macroscópico | RM ponderada em T1, volumes rotulados | Saudável | Não | ||
| NeuronDB | Banco de dados de propriedades e classificação de neurônios | Humano | Neurônio | Descritivo | Saudável | Não | ||
| Colaboração de ferramentas e recursos de neuroimagem (NITRC) | Colaboração gratuita premiada com mais de 1000 ferramentas de software de neuroinformática, conjuntos de dados de imagem e recursos da comunidade, incluindo fóruns e eventos. | Humano, camundongo, rato, outro | Microscópico, macroscópico | Conjuntos de dados | Saudável e doente | Não | ||
| Série de estudos de imagem de acesso aberto (OASIS) | Imagens estruturais de ressonância magnética | Humano | Macroscópico | Conjuntos de dados de ressonância magnética | Doença saudável e de Alzheimer | sim | ||
| Projeto Connectome aberto | Banco de dados de diferentes estruturas de circuitos e conjuntos de dados de neuroimagem, incluindo conjuntos de dados volumétricos, atlas e pesquisa conectômica | Humano, camundongo, morcego, peixe-zebra, inseto, outro | Multinível: regiões do cérebro, conexões, neurônios, padrões de expressão gênica | Imagens e dados 3D | Saudável | Não | ||
| OpenNeuro | Grande e diversificada coleção de dados brutos de vários estudos de pesquisa distribuídos sob licenças permissivas ( CC0 e CC-BY ). Todos os conjuntos de dados são formatados de acordo com o mesmo formato ( Brain Imaging Data Structure ) e podem ser acessados via Amazon S3 . | Humano | Macroscópico | Conjuntos de dados funcionais, estruturais, de difusão por ressonância magnética e magnetoencefalografia | Doenças saudáveis e diversas | Não | ||
| Arquivo MEG aberto (OMEGA) | Magnetoencefalografia , conjuntos de dados estruturais de ressonância magnética e dados demográficos | Humano | Macroscópico | MEG, conjuntos de dados de ressonância magnética T1, dados demográficos | Saudável, TDAH , lesão cerebral traumática | sim | ||
| O Repositório PAIN | Conjuntos de dados estruturais, de difusão e funcionais de ressonância magnética | Humano | Macroscópico Humano | Conjuntos de dados e metadados de ressonância magnética | Condições saudáveis e dolorosas | sim | ||
| Atlas do cérebro de porco | Pig Brain Atlas é um cérebro tridimensional com base em ressonância magnética e atlas do leitão neonatal (Sus scrofa). | Porco (Sus scrofa) | Macroscópico | Ressonância Magnética Estrutural | Saudável | sim | ||
| Banco de dados de tipos de células de primatas | PrimateDatabase.com, um arquivo acessível ao público na web de gravações de patch clamp intracelular e reconstruções digitais tridimensionais altamente detalhadas da morfologia neuronal. | Primata não-humano e humano | Neurônio | Eletrofisiologia, Morfologia e Reconstruções 3-d | Saudável | Não | ||
| SchizConnect | SchizConnect é um banco de dados virtual aberto de busca e download para imagens de neuroimagem de esquizofrenia (MRI) e dados relacionados. | Humano | Macroscópico | Conjuntos de dados estruturais, de difusão e funcionais de ressonância magnética, avaliações cognitivas e clínicas | Esquizofrenia (+ irmãos), Transtorno Bipolar, Controles (+ irmãos) | sim | ||
| Banco de dados Temple EEG | Mais de 30.000 EEGs clínicos e relatórios neurologistas que os acompanham | Humano | Macroscópico | EEG | Doenças saudáveis e diversas | sim | ||
| Conjunto de dados de RM de cérebro inteiro ponderado em T1 de resolução ultra-alta | Dados de RM ponderados em T1 adquiridos usando correção de movimento prospectivo em uma resolução isotrópica ultra-alta de 250 µm. | Humano | Mesoscópico | Conjunto de dados estruturais de ressonância magnética, incluindo dados brutos para processados do scanner | Saudável | Não | ||
| Banco de dados de ressonância magnética UNC-Wisconsin Neurodevelopment Rhesus | Imagens estruturais e de ressonância magnética ponderada por difusão no espaço nativo e atlas | Macaque | Macroscópico | Conjuntos de dados de ressonância magnética | Saudável | Não | ||
| Atlas do cérebro inteiro | Atlas, imagens estruturais de ressonância magnética e imagens PET | Humano | Macroscópico | Imagens | Doenças saudáveis e diversas | Não | ||
| NeuroVault | Mapas estatísticos sem limites de estudos de ressonância magnética e PET. | Humano | Macroscópico | Imagens | Doenças saudáveis e diversas | Não |
Bancos de dados de bancos de dados de neurociência
| Nome | Descrição | Organismo | Nível (gene, neurônio, macroscópico) | Dados (MRI, fMRI, imagens, descritivo, numérico) | Transtorno | Registre-se para visualizar os dados? | Ref. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Neuroscience Information Framework | Um meta banco de dados de dados relevantes para a neurociência que incorpora mais de 100 bancos de dados. | Humano, camundongo, rato, verme | Microscópico, macroscópico | Conjuntos de dados | Saudável e doente | Não |
Agregadores de artigos de neurociência
Feed de neurociência na RightRelevance.