Nomenclatura de ácido nucléico - Nucleic acid nomenclature
Os biólogos moleculares usam vários termos abreviados ao se referir a moléculas de ácido nucleico , como DNA e RNA , coletivamente chamadas de nomenclatura de ácido nucleico .
O mais comum é a representação dos pares de base como letras uma adenina nucleótido é abreviado como A , guanina como L , citosina como C , timina como T , e em ARN, uracilo como L .
Além disso, as posições dos carbonos no açúcar ribose que forma a espinha dorsal da cadeia de ácido nucleico são numeradas e são usadas para indicar a direção dos ácidos nucleicos (5 '-> 3' versus 3 '-> 5'). Isso é conhecido como direcionalidade .
Código de letras expandidas
Além dos símbolos GATC convencionais, há um código de letras expandido para indicar uma posição dentro de uma sequência que pode ser flexível ao definir sequências.
| Carta | Nucleotídeo (s) incluído (s) |
|---|---|
| UMA | UMA |
| T | T |
| G | G |
| C | C |
| você | você |
| R | G ou A |
| Y | T ou C |
| M | A ou C |
| K | G ou T |
| S | G ou C |
| C | A ou T |
| H | A ou C ou T |
| B | G ou T ou C |
| V | G ou C ou A |
| D | G ou T ou A |
| N | G ou T ou A ou C |
Por exemplo, se as sequências conhecidas por se ligar à proteína X são conhecidas como AAAAAAGAAA, AAAAAACAAA, AAAAAATAAA e AAAAAAAAAA, isso pode ser expresso como AAAAAANAAA.
Emparelhamento de bases de hélice tripla
Os pares de bases Watson e Crick são indicados por um "•" ou um "-" ou um "." (exemplo: A • T ou poli (rC) • 2poly (rC)).
Os pares de bases de hélice tripla Hoogsteen são indicados por um "*" ou um ":" (exemplo: C • G * G +, ou T • A * T, ou C • G * G, ou T • A * A).