A eleição para governador da Pensilvânia em 1799 foi entre dois candidatos. O governador em exercício Thomas Mifflin não estava concorrendo. A disputa foi entre o senador federalista dos EUA James Ross e o republicano democrata Thomas McKean. O presidente aposentado da Suprema Corte da Pensilvânia , McKean, era federalista e aliado de Mifflin, pois ambos apoiavam um forte poder executivo estadual, mas rejeitavam as políticas internas do governo nacional.