O programa de futebol masculino da Fairfield Stags começou em 1964. O atleta do Hall da Fama da Fairfield University James Kuhlmann foi o técnico fundador que se dedicou à Universidade e ao desenvolvimento do programa nos 24 anos seguintes. A dedicação e os esforços do técnico Kuhlmann culminaram com os Stags se tornando um candidato rotineiro do MAAC na década de 1980 com os jogadores de destaque Mark Longwell '82 , que jogou pela seleção masculina de futebol dos Estados Unidos e pela NASL Tampa Bay Rowdies , e Alberto Zappala '82 abrindo o caminho.
Campeões do MAAC de 2006
Red Stags Rising
Com o treinador principal Carl Rees no comando na última década, os Stags foram classificados entre os programas de elite do país, tendo produzido sete NSCAA Regional All-Americans e conquistado sete temporadas de vitórias, incluindo vitórias totais de dois dígitos em cinco das últimas 10 campanhas. Em 1998, os Stags obtiveram o recorde de 15 vitórias no programa e conquistaram o 24º lugar no ranking nacional, a primeira vez que apareceram nas 25 melhores pesquisas por qualquer equipe da Fairfield University. Em 1999, os Stags conquistaram seu primeiro título de torneio MAAC e a primeira vaga em play-in da NCAA do programa. Em 2000, os Stags conquistaram o 15º lugar no ranking nacional. Em 2001, os Stags ficaram no ranking nacional por quase duas semanas, atingindo o número 12 do programa. Em 2005, os Stags postaram um recorde de invencibilidade na conferência (8-0-1) pela primeira vez na história da escola e conquistaram o campeonato da temporada regular do MAAC. Os Stags também conquistaram uma classificação nacional nas pesquisas de 2005, em parte graças à invencibilidade durante o mês de outubro (8-0-1).
Temporada de 2006
Em 2006, os Stags se tornaram a primeira equipe de Fairfield em qualquer esporte a passar pela primeira rodada de um Torneio da NCAA, ao derrotar o UConn por 2-1 no Campeonato Masculino de Futebol da NCAA em Storrs, CT. Depois de vencer o campeonato da temporada regular e pós-temporada do MAAC, os Stags, liderados pelos veteranos Alex Cunliffe e Mike Troy, bem como pelos juniores Tom Skara, JP Francini e Sam Bailey, entraram no jogo UConn como perdedores. Um gol do sênior Jimmy Gaughan quebrou um empate 1-1 e goleiro sólido de Francini manteve a liderança para Fairfield, que perturbou os Huskies. Os Stags perderam para Towson no segundo turno, mas serão lembrados como uma das melhores equipes atléticas da história da escola.
