David J. Lipman - David J. Lipman
David Lipman | |
|---|---|
.jpg) David Lipman em junho de 2013
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| Nascer | David J. Lipman |
| Alma mater |
Brown University University em Buffalo, The State University of New York |
| Conhecido por | Influência no desenvolvimento do BLAST (biotecnologia) |
| Prêmios |
Membro do Prêmio ISCB de Cientista Sênior da Academia Nacional de Ciências dos EUA Fellow do ISCB |
| Carreira científica | |
| Campos |
Bioinformática Biologia computacional Métodos de comparação de sequências Genômica comparativa Evolução molecular |
| Instituições |
Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia Brown University University em Buffalo, The State University of New York |
| Alunos notáveis |
Stephen Altschul Mark Boguski |
| Local na rede Internet | www |
David J. Lipman é um biólogo americano que, de 1989 a 2017, foi Diretor do National Center for Biotechnology Information (NCBI) do National Institutes of Health . O NCBI é o lar do GenBank , o nó norte-americano do International Sequence Database Consortium , e do PubMed , um dos sites mais usados no mundo para a pesquisa e recuperação de informações biomédicas. Lipman é um dos autores originais do programa de alinhamento de sequências BLAST e uma figura respeitada em bioinformática . Em 2017, ele deixou o NCBI e se tornou Diretor de Ciência da Impossible Foods .
Educação
Lipman recebeu seu diploma de graduação da Brown University e seu MD em 1980 pela University at Buffalo, The State University of New York
Carreira
Lipman foi o diretor fundador do National Center for Biotechnology Information , parte da National Library of Medicine do US National Institutes of Health. Sob sua liderança, o NCBI cresceu de menos de uma dúzia de pessoas para mais de 500 funcionários científicos, e agora hospeda centenas de bancos de dados científicos e médicos, incluindo GenBank , PubMed , PubMed Central , dbGaP, dbSNP, Sequence Read Archive (SRA), RefSeq , PubChem e muitos mais. O programa de pesquisa interna do NCBI incluiu grupos liderados por Stephen Altschul (outro co-autor do BLAST), David Landsman, Eugene Koonin (um autor prolífico em genômica comparada ) e L. Aravind.
Lipman é muito conhecido por seu trabalho seminal em uma série de algoritmos de similaridade de sequência, começando com o algoritmo de Wilbur-Lipman em 1983, FASTA search search em 1985, BLAST em 1990 e Gapped BLAST e PSI-BLAST em 1997. BLAST eventualmente se tornou o programa de alinhamento de sequência mais amplamente usado e altamente citado (mais de 160.000 citações em 2021) no campo, e o servidor NCBI BLAST hoje é um de seus recursos mais usados.
Lipman também trabalhou por muitos anos com Dennis A. Benson e outros no NCBI na manutenção e melhoria do GenBank , um dos maiores bancos de dados do mundo de dados de sequências de genoma e proteínas. O GenBank, junto com o European Nucleotide Archive e o DNA Data Bank of Japan, formam a International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC), um banco de dados totalmente aberto e irrestrito de sequências do genoma que tem sido o repositório mundial desses dados desde 1990.
Ele foi um dos criadores do Projeto de Sequenciamento do Genoma da Influenza , um projeto para sequenciar e disponibilizar os genomas de milhares de isolados do vírus da gripe.
Ele foi um dos signatários originais da Declaração da Bethesda sobre Publicação de Acesso Aberto .
Ele também é o editor-chefe de um periódico científico on-line revisado por pares , de acesso aberto , chamado Biology Direct .
Em maio de 2017, Lipman deixou seu cargo no NCBI para ingressar na empresa de carnes vegetais Impossible Foods como Diretor Científico.
Premios e honras
Lipman recebeu o prêmio Association of Biomolecular Resource Facilities Award por suas contribuições excepcionais para as tecnologias biomoleculares em 1996.
Em 2000, foi eleito para a Academia Nacional de Medicina .
Em 2004, ele foi premiado com o Prêmio Cientista Sênior do ISCB e eleito um Fellow do ISCB em 2009 pela Sociedade Internacional de Biologia Computacional .
Em 2005, o Dr. Lipman foi eleito para a Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos .
Em 2013, ele recebeu o prêmio de Campeão da Mudança de "Ciência Aberta" da Casa Branca .
Referências
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Scholia tem um perfil de autor para David J. Lipman . |