A eleição para prefeito de El Paso em 2003 foi realizada em 3 de maio de 2003 para eleger o prefeito de El Paso, Texas . Ele viu a eleição de Joe Wardy , que destituiu o atual prefeito Raymond Caballero .
Esta foi a primeira eleição para prefeito de El Paso realizada sob novas regras, que viu uma mudança do sistema anterior em que uma primária apartidária era seguida por uma eleição geral dos dois primeiros colocados para um novo sistema em que um segundo turno é realizado apenas se não candidato recebe a maioria dos votos no primeiro turno. Esta foi a última eleição para prefeito de El Paso para um mandato de dois anos, já que os mandatos deveriam ser estendidos para quatro anos a partir da eleição de 2005 subsequente.
Nenhum segundo turno foi necessário, pois Wardy garantiu a maioria dos votos no turno inicial.