Superfamília do fator de necrose tumoral - Tumor necrosis factor superfamily

Superfamília do fator de necrose tumoral
Fator de necrose tumoral de camundongo Alpha.png
Estrutura trimérica do TNF alfa, produzida por Mus musculus , baseada na estrutura 2TNF do PDB (resolução de 1,4 Å). Cores diferentes representam monômeros diferentes. Baeyens, KJ et al. (1999). Figura renderizada usando FirstGlance Jmol.
Identificadores
Símbolo TNF
Pfam PF00229
InterPro IPR006052
PRÓSITO PDOC00224
SCOP2 1tnf / SCOPe / SUPFAM
Superfamília OPM 292
Proteína OPM 2hew
Membranome 80
TNF
PDB 1du3 EBI.jpg
estrutura cristalina de trail-sdr5
Identificadores
Símbolo TNF
Pfam PF00229
Clã Pfam CL0100
InterPro IPR006052
PRÓSITO PDOC00561
SCOP2 1tnr / SCOPe / SUPFAM

A superfamília do fator de necrose tumoral ( TNF ) é uma superfamília de proteínas de proteínas transmembrana do tipo II contendo o domínio de homologia de TNF e formando trímeros . Os membros desta superfamília podem ser liberados da membrana celular por clivagem proteolítica extracelular e funcionam como uma citocina . Essas proteínas são expressas predominantemente por células imunes e regulam diversas funções celulares, incluindo resposta imune e inflamação, mas também proliferação, diferenciação, apoptose e embriogênese.

A superfamília contém 19 membros que se ligam a 29 membros da superfamília de receptores de TNF . Uma ocorrência de ortólogos em invertebrados indica a origem antiga desta superfamília em evolução.

O padrão PRÓSITO desta superfamília está localizado em uma folha beta na seção central da proteína que é conservada em todos os membros.

Membros

Existem 19 membros da família, numericamente classificados como TNFSF #, onde # denota o número do membro, às vezes seguido por uma letra.

TNFSF # Nome Sinônimos Gene Função
1 Linfotoxina alfa TNFβ, TNFSF1B LTA Indução de inflamação e resposta antiviral, desenvolvimento de órgãos linfóides secundários , papel na tumorigênese
2 Fator de necrose tumoral TNFα, Dif, Necrosin, TNFSF1A, ... TNF Regulação das células imunes, indução de febre , caquexia , inflamação e apoptose , inibição da tumorigênese e replicação viral e resposta à sepse
3 Linfotoxina beta TNFγ LTB Indução de inflamação e resposta antiviral, desenvolvimento de órgãos linfóides secundários , papel na tumorigênese
4 Ligante OX40 CD252, Gp34, CD134L TNFSF4 A activação de células T de resposta imune por células T de co-estimulao
5 Ligante CD40 CD154, TRAP, Gp39, T-BAM CD40LG Regulação da resposta imune adaptativa pela ativação da célula apresentadora de antígeno
6 Ligante Fas CD178, APTL, CD95L FASLG Regulação da homeostase de células T por indução de apoptose
7 Ligante CD27 CD70 CD70 Regulação da ativação das células B e homeostase das células T
8 Ligante CD30 CD153 TNFSF8 Indução de apoptose de células T e B , prevenção da autoimunidade
9 Ligante CD137 4-1 BBL TNFSF9
10 Ligante indutor de apoptose relacionado a TNF CD253, APO-2L TNFSF10 Inibição da tumorigênese , indução de apoptose
11 Ativador de receptor de ligante de fator nuclear kappa-Β CD254, OPGL, TRANCE, ODF TNFSF11 Crescimento de tecido (particularmente regeneração e remodelação óssea), maturação de células dendríticas
12 Indutor fraco de apoptose relacionado ao TNF APO-3L, DR3L TNFSF12 Regulação da angiogênese , indução de apoptose
13 Um ligante indutor de proliferação CD256, TALL-2, TRDL1 TNFSF13 Regulação do desenvolvimento das células B e sobrevivência das células plasmáticas
13B Fator de ativação de células B CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... TNFSF13B Estimulação da proliferação e diferenciação de células B
14 CLARO CD258, HVEML TNFSF14 Estimulação da proliferação de células T , regulação da apoptose
15 Inibidor de crescimento endotelial vascular TL1, TL-1A TNFSF15 Inibição da angiogênese
18 Membro 18 da superfamília TNF GITRL, AITRL, TL-6 TNFSF18 Regulação da sobrevivência das células T
19 Ectodisplasina A ED1-A1, ED1-A2 EDA Desenvolvimento de tecidos ectodérmicos

Referências

Este artigo incorpora texto do domínio público Pfam e InterPro : IPR006052

links externos